يهدف التنسيق والتعاون في مجال السياسة الخارجية إلى صياغة مواقف مشتركة وموحدة تجاه القضايا السياسية ، التي تهم دول مجلس التعاون في الأطر العربية والإقليمية والدولية ، والتعامل كتجمع واحد مع العالم ، في إطار الأسس والمرتكزات القائمة على الاحترام المتبادل ، وعدم التدخل في الشؤون الداخلية ومراعاة المصالح المشتركة ، وبما يصون مصالح دول المجلس ، ويعزز أمنها واستقرارها ورخاء شعوبها . ويمكن تلخيص أهم الأهداف السياسية للمجلس فيما يلي :
* خلال عقد الثمانينات تلخصت أهم أهداف مجلس التعاون السياسية والإستراتيجية في الحفاظ على أمن دول المجلس واستقرارها من خلال التصدي لمُسببات عدم الاستقرار ، ومصادر الخطر التي تمثلت بشكل أســاسي ومُباشر في الحرب العراقية . الإيرانية ، الأمر الذي تطلب تحركاً جماعياً لدول مجلس التعاون ، للحيلولة دون انتشار رقعة تلك الحرب.
* في التسعينات ، مثّل عدوان النظام العراقي السابق على دولـة الكويت واحتلالها ، التحدي الأمني الأكثر خطورة منذ قيام المجلس ، حيث حظي تحرير دولة الكويت بأولوية مطلقة.

* بعد التحرير ، تطلب الموقف عملاً دبلوماسياً مشتركاً مكثفاً ، لمساندة الشرعية الدولية في سعيها لإلزام العراق بتنفيذ قرارات مجلس الأمن ذات الصلة بعدوانه على دولة الكويت.
* مساندة ودعم دولة الإمارات العربية المتحدة في حقها باستخدام كافة الوسائل السلمية لاستعادة سـيادتها على جزرها الثلاث ، طنب الكبرى ، وطنب الصغرى ، وأبو موسى، التي تحتلها إيران منذ عهد الشاه عام 1971م ، وحتى الوقت الحاضر.
* وفي الإطار العربي ، العمل بشكل جماعي لدعم القضايا العربية ، وعلى رأسها القضية الفلسطينية ، ودعم مسيرة السلام في الشرق الأوسط ، مع التمسك بالحقوق العربية.
* دعم ومناصرة القضايا الإسلامية.