أقرّ المجلس الأعلى في دورته السابعة عشرة (الدوحة ، ديسمبر 1996) السياسة الزراعية المشتركة ، التي تم تعديلها في العام 2004 ، بهدف تحقيق التكامل الزراعي بين دول المجلس وفق إستراتيجية موحدة تعتمد على الاستخدام الأمثل للموارد المائية المتاحة وتوفير الأمن الغذائي من مصادر وطنية ، وزيادة الإنتاج ، وتشجيع المشاريع المشتركة بمساهمة من القطاع الخاص.

وتتضمن السياسـة الزراعية عدة برامج للعمـل المشـترك تتلخص في ما يلي:

1. البرنامج المشترك لتنسيق الخطط والسياسات الزراعية الذاتية.

2. البرنامج المشترك لمسوحات واستغلال وصيانة الموارد الطبيعية.

3. البرنامج المشترك للإنتاج الزراعي الغذائي.

       وتقوم لجنة التعاون الزراعي واللجان الفنية التابعة لها بتنفيذ برامج هذه السياسة ، حيث نفذ العديد من البرامج والمشاريع والدراسات الواردة في هذه السياسة.